Новый обзор изменений ДНК мог помочь поиску генов рака

Исследователи сказали, что отображение неправильных регионов дает ученым рака отправную точку, от которой можно искать пока еще неоткрытые онкогены и сломанные гены-супрессоры опухоли, которые позволяют клеткам делиться и расти неудержимо. Изданный в октябрьском выпуске Генетики Природы, результаты – часть продолжающейся международной научно-исследовательской работы, чтобы определить пейзаж мутаций ДНК и других генетических изменений, которые питают развитие рака.Авторы сказали, что это – самый большой анализ на дату роли ДНК «изменения числа копии» через несколько типов рака.

Нормальные клетки несут две копии 20 000 генов, которые составляют геном. Геномы раковых клеток, как правило, пронизываются областями, где генетические последовательности дублированы или удалены; на самом деле изменения числа копии затрагивают больше генома, чем какая-либо другая ненормальность ДНК при раке. Цель исследования состояла в том, чтобы определить образцы изменений числа копии и определить, как они способствуют раку.

В обзоре 4 934 случаев рака 11 типов, «мы нашли, что раковые образования часто подвергаются удвоению всех геномов, сопровождаемых большими количествами меньших событий изменения числа копии», сказал Рэмин Берухим, Мэриленд, доктор философии, доцент Медицины в Дане-Фарбере и ассоциированном члене Широкого Института. «Мы также видели, что склонность числа копии изменяется, чтобы произойти в теломерах [подсказки хромосом], и они показывают особенности, указывающие, что они являются результатом различных механизмов, чем изменения числа копии регионов в хромосомах».Beroukhim – co-ведущий-автор отчета наряду с Мэтью Мейерсоном, Мэриленд, доктора философии, Даны-Фарбера и Широкого, и Гэд Гетц, доктор философии, Центральной больницы Массачусетса и Широкого.

Анализ также показал 70 областей генома рака, которые подвергаются дублированиям – также известный как увеличения – чаще, чем ожидалось бы случайно и 70 регионов, которые содержат удаления чаще, чем ожидалось бы случайно. «Мы ожидаем, что эти 140 регионов будут содержать много пока еще неизвестных онкогенов и генов-супрессоров опухоли», сказал Берухим.В среднем эти 140 регионов включали три – четыре гена.

Однако только 35 из регионов содержали известные онкогены или гены-супрессоры опухоли, ранее связанные с раком. «Таким образом, есть много, что осталось обнаружить в геноме рака», сказал Берухим. «Эти регионы предоставляют научному сообществу отправную точку, чтобы оценить возможные новые онкогены и гены-супрессоры опухоли». Результаты были сделаны доступными на публично доступном веб-сайте, http://www.broadinstitute.org/tcga.Он добавил, что дальнейшее исследование базы данных изменения числа копии, произведенной исследователями «, поможет нам понять лучше, как возникают раковые образования и что включены гены.

И когда мы понимаем, что, можем развивать диагностику и терапию, которые противодействуют тем генам».


Блог обо всем