Исследования аутоиммунных и воспалительных заболеваний выявили сотни генетических областей, которые, как считается, связаны с этими состояниями. В то же время исследования локусов количественных признаков экспрессии (eQTL) выявили множество унаследованных вариаций уровней экспрессии генов в нормальной человеческой популяции. Хотя широко распространено мнение, что большинство локусов, связанных с заболеванием, влияют на риск заболевания через регуляторные вариации в экспрессии генов, эта гипотеза не была официально проверена путем проверки того, обнаруживаются ли большинство генетических локусов, влияющих на риск заболевания, как eQTL. В попытке проверить эту гипотезу исследователи из BWH и их коллеги взяли около 270 генетических локусов, связанных с семью заболеваниями, и попытались сопоставить их с причинными генами, используя eQTL в ключевых иммунных клетках.
Они сообщают о своих результатах в Nature Genetics.
Команде удалось определить 55 из этих ассоциаций с генами-кандидатами с сильной статистической согласованностью с вариациями базовой экспрессии генов в нестимулированных иммунных клетках. Однако это лишь небольшая часть – около 25 процентов – исследованных генетических локусов. В остальном, исследователи не наблюдали никаких сигналов в данных eQTL, которые соответствовали бы ассоциациям аутоиммунных заболеваний, несмотря на то, что релевантные для заболевания клеточные популяции легче получить из образцов крови по сравнению с другими заболеваниями.
"Следует проявлять крайнюю осторожность, прежде чем можно будет сделать вывод о патологической релевантности наблюдаемого eQTL просто на основании близости к ассоциации с заболеванием," авторы пишут. "Поэтому убедительные доказательства общего генетического эффекта должны быть получены до того, как будет предпринято трудоемкое и дорогостоящее экспериментальное изучение таких эффектов."